通常氣相色譜儀色譜定量的基礎是色譜峰面積或是峰高，所以氣相色譜儀一般色譜峰面積或是峰高判斷和測量的準確性將會直接的影響定量的結果。相對而言，用高定量對分離度的要求是要比用峰面積定量低的。所以，在分離度低的情況下，比較適合用氣相色譜儀峰高定量，保留時間短以及半峰寬窄的峰，其半峰寬測定誤差相對會較大，影響到氣相色譜儀峰面積的測量，所以也比較適合用峰高定量。